Кандидат технічних наук зі спеціальності 05.23.01 - будівельні конструкції, будівлі і споруди (1990), доктор технічних наук зі спеціальності 05.05.11 - машини і засоби механізації сільськогосподарського виробництва (2004), професор по кафедрі теоретичної та прикладної механіки (2005). Член спеціалізованої вченої ради з присудження наукового ступеня доктора наук. Під його керівництвом захищено 4 кандидатські дисертації. Академік Академії наук вищої школи України. Творчий доробок Пастушенка С.І. складається з 345 опублікованих науково-методичних праць, серед яких - 1 монографія, 2 підручника і 12 навчальних посібників з грифами МОН України і Міністерства аграрної політики України, 20 патентів, авторських свідоцтв на винаходи та про реєстрацію авторського права, 4 типові програми з навчальних дисциплін. Експерт Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти зі спеціальності 208–Агроінженерія. Іноземний член Комісії з питань моторизації та сільського господарства Відділу Польської академії наук у Любліні. Член редакційних колегій наукових фахових збірників України (Вісник аграрної науки Причорномор'я) і Польщі (TЕКА та MOTROL). Резидент «Кабінету експертів» громадянського руху «Всі разом!» у галузі – «Освіта та інновації».
- Проектування технологічних процесів;
- Технічний сервіс машин;
- Паливно-мастильні та інші експлуатаційні матеріали;
- Аналіз технологічних систем та обгрунтування рішень;
- Моделювання технологічних процесів і систем та використання ІКТ в АПК.
- Посвідчення про проходження атестації в атестаційній комісії Таврійського державного агротехнічного університету щодо володіння державною мовою. Посвідчення №00718 від 05.06.2019 р.;
- Сертифікат про закінчення курсу "Експерт з акредитації освітніх програм: онлайн тренінг", наданий Національним агентством із забезпечення якості вищої освіти через платформу масових відкритих онлайн-курсів Prometheus. 07.10.2019 р. (5 годин / 0,16 кредити ECTS);
- Сертифікат про участь у міжнародній конференції Unicheck Україна «Академічна доброчесність: практичний вимір» м. Київ 11-12 квітня 2019 р.;
- Сертифікат про участь у Міжнародній науково-практичній конференції «Дуальна форма здобуття освіти: успіхи та проблеми першого року запровадження пілотного проєкту у закладах фахової передвищої освіти України». № СС 38282994/1778-20 від 22.10.2020 р. (8 годин / 0,25 кредита ECTS);
- Сертифікат про успішну серію тренінгів на тему: «Впровадження елементів дуального навчання в навчальний процес». 18-29 січня 2021 року (40 годин / 1,3 кредити ECTS);
- Національний університет біоресурсів і природокористування України, ННІ неперервної освіти і туризму. Підвищення кваліфікації науково-педагогічних працівників аграрних закладів вищої освіти за програмою «Створення і використання цифрового освітнього контенту на базі CLMS» Сертифікат №СС00493706/014233-21, травень 2021р., (60 годин / 2 кредити ECTS);
- Стажування у Тернопільському національному технічному університеті імені Івана Пулюя згідно наказу №4/7-559 від 16.05.2023 (60 год. / 2 кредити ECTS).